Thủ tục cấp, thu hồi, điều chỉnh Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư:

Đối với dự án thuộc diện chấp thuận chủ trương đầu tư đồng thời với chấp thuận nhà đầu tư, trong thời hạn 05 ngày làm việc kể từ ngày nhận được văn bản quyết định chấp thuận chủ trương đầu tư đồng thời với chấp thuận nhà đầu tư, cơ quan đăng ký đầu tư cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư cho nhà đầu tư.

Đối với dự án đầu tư thuộc thẩm quyền chấp thuận chủ trương đầu tư của từ 02 Ủy ban nhân dân cấp tỉnh trở lên, căn cứ đề nghị của Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Thủ tướng Chính phủ giao Sở Kế hoạch và Đầu tư của một tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương nơi nhà đầu tư thực hiện dự án đầu tư, đặt hoặc dự kiến đặt văn phòng điều hành để thực hiện dự án đầu tư cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư

Đối với dự án đầu tư đã được chấp thuận chủ trương đầu tư và nhà đầu tư đã trúng đấu giá, trúng thầu; dự án đầu tư thuộc diện chấp thuận nhà đầu tư theo quy định tại khoản 3 Điều 29 Luật Đầu tư và thuộc diện cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, nhà đầu tư nộp văn bản đề nghị cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư cho cơ quan đăng ký đầu tư để được cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư trong thời hạn 05 ngày làm việc kể từ ngày cơ quan đăng ký đầu tư nhận được văn bản đề nghị.

Đối với dự án không thuộc diện cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, nếu có nhu cầu cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, nhà đầu tư nộp văn bản đề nghị cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, bản sao hợp lệ Quyết định chấp thuận chủ trương đầu tư và bản sao hợp lệ Quyết định chấp thuận nhà đầu tư (nếu có) cho cơ quan đăng ký đầu tư để được cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư trong thời hạn 05 ngày làm việc kể từ ngày nhận được văn bản đề nghị.

- Điều 44 đến Điều 55 quy định cụ thể về điều kiện, hồ sơ và trình tự, thủ tục điều chỉnh dự án đầu tư trong từng trường hợp. Điểm mới của Nghị định là quy định hướng dẫn về trường hợp chuyển nhượng một phần dự án đầu tư. Theo đó, nhà đầu tư chuyển nhượng dự án đầu tư thực hiện thủ tục điều chỉnh Quyết định chủ trương đầu tư, Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư. Quyết định chấp thuận điều chỉnh chủ trương đầu tư, Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư điều chỉnh ghi nhận nội dung điều chỉnh, nội dung không điều chỉnh và được cấp cho nhà đầu tư chuyển nhượng dự án và nhà đầu tư nhận chuyển nhượng dự án.

- Điều 50 quy định cụ thể điều kiện, trình tự, thủ tục điều chỉnh dự án trong các trường hợp chia, tách, sáp nhập dự án đầu tư.  Các Điều 52, 53 hướng dẫn thủ tục thực hiện quy định mới tại khoản 1 Điều 41 của Luật Đầu tư về việc điều chỉnh dự án trong trường hợp sử dụng quyền sử dụng đất, tài sản trên đất thuộc dự án đầu tư để hợp tác kinh doanh.

- Các Điều 51, 54 quy định về điều chỉnh dự án đầu tư trong trường hợp chia, tách, sáp nhập, chuyển đổi loại hình tổ chức kinh tế; điều chỉnh dự án đầu tư theo bản án, quyết định của tòa án, trọng tài.

- Điều 55 quy định về điều chỉnh, gia hạn thời hạn hoạt động của dự án đầu tư. Đối với dự án đầu tư có sử dụng đất, trong thời hạn tối thiểu 06 tháng trước khi hết thời hạn hoạt động của dự án đầu tư, nhà đầu tư thực hiện thủ tục gia hạn thời hạn hoạt động của dự án đầu tư.

Thủ tục ngừng, chấm dứt hoạt động của dự án đầu tư:

Điều 56 quy định bổ sung về điều kiện và thủ tục ngừng hoạt động của dự án đầu tư trong các trường hợp nhà đầu tư tự quyết định ngừng hoạt động của dự án đầu tư và trường hợp ngừng hoạt động của dự án đầu tư theo quyết định của cơ quan quản lý nhà nước về đầu tư.

Nghị định quy định chi tiết Luật Đầu tư về việc ngừng, chấm dứt hoạt động của dự án đầu tư  gây phương hại hoặc có nguy cơ gây phương hại đến quốc phòng, an ninh quốc gia như sau: Ủy ban nhân dân cấp tỉnh thông báo bằng văn bản cho Bộ Kế hoạch và Đầu tư. Thông báo gồm các nội dung sau: nhà đầu tư thực hiện dự án; mục tiêu, địa điểm, nội dung dự án, quá trình thực hiện dự án; đánh giá tác động hoặc nguy cơ ảnh hưởng của dự án đối với quốc phòng, an ninh quốc gia; kiến nghị về việc ngừng toàn bộ hoặc ngừng một phần hoạt động của dự án đầu tư. Căn cứ đề nghị của Ủy ban nhân dân cấp tỉnh, Bộ Kế hoạch và Đầu tư lấy ý kiến Bộ Quốc phòng, Bộ Công an để trình Thủ tướng Chính phủ quyết định ngừng toàn bộ hoặc ngừng một phần hoạt động của dự án đầu tư.

Các Điều 57, 58, 59, 60 quy định điều kiện, thủ tục chấm dứt hoạt động của dự án đầu tư, thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư và thanh lý dự án đầu tư; chấm dứt hoạt động của dự án đầu tư trong trường hợp Cơ quan đăng ký đầu tư không liên lạc được với nhà đầu tư; chấm dứt hiệu lực của văn bản chấp thuận chủ trương đầu tư; bổ sung quy định về việc chấm dứt hoạt động của dự án đầu tư trong trường hợp nhà đầu tư thực hiện hoạt động đầu tư trên cơ sở giao dịch dân sự giả tạo theo quy định của pháp luật về dân sự và chấm dứt hoạt động của dự án đầu tư theo bản án, quyết định của Tòa án, phán quyết trọng tài.

Lưu ý: Rủi ro đối với dự án đầu tư hình thành do giao dịch giả tạo:

Cơ quan đăng ký đầu tư có quyền quyết định chấm dứt toàn bộ hoặc một phần hoạt động của dự án đầu tư trong trường hợp nhà đầu tư thực hiện hoạt động đầu tư trên cơ sở giao dịch dân sự giả tạo được xác định theo quy định của pháp luật về dân sự, trên cơ sở bản án, quyết định có hiệu lực của Tòa án hoặc phán quyết của trọng tài. Cơ quan đăng ký đầu tư, cơ quan, tổ chức cá nhân có liên quan có quyền đề nghị Tòa án cấp có thẩm quyền tuyên bố vô hiệu giao dịch dân sự do giả tạo trong quá trình thực hiện dự án đầu tư của nhà đầu tư để làm cơ sở chấm dứt toàn bộ hoặc chấm dứt một phần hoạt động của dự án đầu tư.